MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 6022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013416	T	6	6	357907	357912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013416	A	6	6	357935	357940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013416	A	7	7	359075	359081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013416	T	6	6	360252	360257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013416	TCCC	2	8	360261	360268	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1006	NC_013416	CAC	2	6	360322	360327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_013416	A	6	6	360399	360404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013416	CTGC	2	8	360421	360428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_013416	T	6	6	360433	360438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013416	AATA	2	8	362099	362106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013416	TTAGTT	2	12	362108	362119	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013416	T	6	6	362118	362123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013416	GTT	2	6	362141	362146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013416	T	6	6	362157	362162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013416	GAG	2	6	362163	362168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013416	TCA	2	6	365367	365372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013416	ATG	2	6	365424	365429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013416	TGC	2	6	365441	365446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013416	T	7	7	365487	365493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013416	TTAT	2	8	365497	365504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013416	T	6	6	365531	365536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013416	T	7	7	365553	365559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013416	ATTCA	2	10	365584	365593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_013416	TTTA	2	8	366711	366718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013416	T	7	7	368330	368336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013416	T	6	6	368390	368395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013416	ATGTTA	2	12	369558	369569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013416	TCA	2	6	370127	370132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013416	TAA	2	6	370409	370414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013416	A	6	6	370424	370429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013416	TAA	2	6	370771	370776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013416	TTG	2	6	372769	372774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013416	CA	3	6	372800	372805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_013416	ATA	2	6	372894	372899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013416	AGT	2	6	373319	373324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013416	TAAA	2	8	373327	373334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013416	AAG	2	6	373436	373441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013416	GACC	2	8	373487	373494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_013416	ATA	2	6	373527	373532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013416	T	7	7	374140	374146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013416	T	6	6	375033	375038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013416	TGA	2	6	376777	376782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013416	A	6	6	378917	378922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013416	TCA	2	6	378954	378959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013416	GCT	2	6	379675	379680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013416	AAC	2	6	381621	381626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013416	ACA	2	6	381648	381653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013416	T	6	6	381681	381686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013416	A	6	6	381707	381712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013416	GACTGT	2	12	381858	381869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1051	NC_013416	GT	4	8	381875	381882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013416	CG	3	6	381899	381904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_013416	ACA	2	6	381971	381976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013416	CCT	2	6	381980	381985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_013416	ACC	2	6	382033	382038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_013416	T	6	6	382054	382059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013416	TTGAA	2	10	382078	382087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013416	A	6	6	382126	382131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013416	CAA	2	6	382152	382157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013416	AAC	2	6	382201	382206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013416	T	6	6	383037	383042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013416	GTC	2	6	383061	383066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013416	GAAT	2	8	383072	383079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013416	TAA	2	6	388091	388096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013416	T	7	7	388128	388134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013416	TAGG	2	8	388148	388155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013416	TGAA	2	8	388180	388187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013416	CGTT	2	8	388188	388195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_013416	T	6	6	388207	388212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013416	A	7	7	388234	388240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013416	T	6	6	388250	388255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013416	TCAT	2	8	388267	388274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_013416	A	6	6	389145	389150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013416	TTG	2	6	391455	391460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013416	TGT	2	6	391483	391488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013416	ATGA	2	8	391559	391566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013416	AAG	2	6	391582	391587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013416	TTAGG	2	10	394383	394392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013416	AATGA	2	10	394415	394424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013416	AAT	2	6	398999	399004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013416	ACCCG	2	10	399077	399086	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1082	NC_013416	CT	3	6	399866	399871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_013416	AATT	2	8	399889	399896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013416	A	6	6	401244	401249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013416	T	7	7	403326	403332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013416	CAAA	2	8	404837	404844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_013416	A	6	6	405731	405736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013416	GTTAA	2	10	408409	408418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013416	CAAAAG	2	12	408464	408475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1090	NC_013416	AAT	2	6	412221	412226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013416	CGA	2	6	412382	412387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013416	ATA	2	6	412937	412942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013416	A	6	6	414960	414965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013416	TCA	2	6	414990	414995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013416	TGC	2	6	415000	415005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013416	CTT	2	6	415499	415504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013416	A	7	7	415522	415528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013416	AGAA	2	8	415553	415560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013416	CAA	2	6	415572	415577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013416	CTT	2	6	415637	415642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013416	GCA	2	6	418522	418527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013416	CGT	2	6	419029	419034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013416	T	6	6	419462	419467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013416	A	6	6	422594	422599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013416	AGA	2	6	423062	423067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013416	CT	4	8	423180	423187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_013416	T	6	6	423190	423195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013416	TAAA	2	8	423209	423216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013416	TATT	2	8	423218	423225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013416	CTTT	2	8	423226	423233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_013416	AT	3	6	423287	423292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013416	AT	3	6	423315	423320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013416	A	6	6	423329	423334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013416	TAA	2	6	423391	423396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013416	CGA	2	6	423454	423459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013416	ATA	2	6	423500	423505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013416	TAA	2	6	423513	423518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013416	T	6	6	425210	425215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013416	CGG	2	6	427845	427850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013416	ATC	2	6	428570	428575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013416	T	6	6	428577	428582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013416	A	6	6	429289	429294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013416	CTT	2	6	429329	429334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_013416	TAT	2	6	431112	431117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013416	ATT	2	6	432110	432115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013416	ATT	2	6	432122	432127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013416	TGTGT	2	10	432701	432710	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013416	ACC	2	6	432776	432781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_013416	ACCG	2	8	432800	432807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_013416	A	6	6	432821	432826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013416	CGG	2	6	433262	433267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_013416	TCAAT	2	10	433329	433338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_013416	ACA	2	6	435353	435358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013416	GAA	2	6	435420	435425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013416	ATA	2	6	435429	435434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013416	AGA	2	6	435444	435449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013416	A	6	6	436339	436344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_013416	CGC	2	6	436427	436432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1423	NC_013416	GAT	2	6	526306	526311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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